Autre exemple du rôle pionnier de Faber-Castell en matière d'environnement, le vernis utilisé pour ses crayons graphite et de couleur. En 1992, Faber-Castell fut le premier fabricant à utiliser la technologie du vernis à l'eau. A Stein, près de Nuremberg, presque tous les crayons sont recouverts d'un vernis à l'eau respectueux de l'environnement. Par ce procédé, Faber-Castell a abandonné les vernis traditionnels à base de solvants organiques au profit d’une émulsion aqueuse écologique. Cette technologie développée par l'entreprise fut inaugurée en personne par le ministre de l'écologie de l'époque, Klaus Töpfer (aujourd’hui directeur exécutif des programmes environnementaux des Nations Unies). Avec cette technologie du verni à l'eau, Faber-Castell a établi de nouveaux standards dans le domaine des vernis recouvrant les crayons.
Dans la technologie du vernis à l'eau, les pigments de coloration sont mélangés à de l'eau. Par conséquent, lors de son séchage, et contrairement aux vernis à base d’acétone, aucune vapeur nocive ne se dégage. Le vernis à l'eau doit être séché à chaud ce qui, comparé aux vernis à base d’acétone, nécessite une plus grande quantité d'énergie. Faber-Castell génère l’énergie requise en utilisant des résidus de la production de crayons à gaine de bois.